生物分類法，稱為科學分類法，是用來生物物種進行分組和歸類方法。
這有助於我們理解和組織生物多樣性，以及描述和識別生物種類之間關係，級基礎系統層次結構中使用一個數量層次，域、界、門、綱、目、科、屬和種。
無級別系統使用任意數量層次。
分類的羣體稱分類元。
現代生物分類法源於林奈系統，他物種共有生理特徵分類。
林奈後，達爾文關於祖先原則，此係統逐改進。
近年來，分子系統學（Molecular phylogenetics）使用生物信息學技術來研究基因組DNA，許多傳統分類進行了改變。
儘管林奈當時生物分類只是鑒，現在人們贊類應反映出達爾文關於祖先原則。
隨著1960年代支序分類（cladistics），或稱分支學説（cladism）出現，一個分類羣定位演化樹某個位置。
如果一个分类群包括且仅包括某一个祖先所有后代，称其单系群（monophyly）；而若该分类群包括其祖先，但包括其所有后代，称之为拟系群（paraphyly）；而如果该分类群包括其最近祖先，称之为复系群（polyphyly）。
分支學說主張分類應該基於單系群，而非並系群或複系群。
目前有一種名為「PhyloCode」命名法正在規劃中，旨在處理演化支（clade）而非類羣（拉丁文taxon，複數taxa）。
現在，這種命名方式是否可以與其他命名方式共存？
傳統分類受到林奈兩界說影響。
這種說法生物分為動物和植物兩個王國（界），這種分類二十世紀微生物和真菌研究中發現是適用。
第一次突破兩界説是1925年厄多爾德雀頓提出。
他引用政治和歷史上概念，創立了一個分類單位，稱為「域」。
舉例，如果我們誤認一種看起來相似但實際上有毒生物，可能會誤食它們而導致中毒。
分類法中，域或稱總界是單元。
三域系統最初創立於1990年，此後學界承認。
目前，大多數學者接受這個系統，但有一些學者遵循五界系統。
三域系統基本特徵是原本細菌界（或稱原核生物界）中古細菌和真細菌獨立成為菌域，以及古菌域。
有一些學者細菌列為第六個界，但三域系統接受三個菌域分類。
生命形式分類系統是希臘哲學家亞裏士多德所建立。
他動物運動方式（飛行、行走或游泳）進行了分類。
1172年塞維利亞法官伊本·路世德（ibn Rushd，即阿維羅伊Averroes）亞裏士多德《論靈魂》（拉丁文de Anima）翻譯成阿拉伯文並刪節。
其原始註解佚，但斯考特（Michael Scot）翻譯拉丁文版本流傳。
明代李時珍他藥典《本草綱目》中，將生物藥材分為部分，包括草、穀、菜、果、木、蟲、鱗、介、禽、獸和人。
瑞士教授康拉德·格斯納（Conrad Gesner, 1516–1565）當時已知生物進行了分析性歸納。
卡爾·林奈（Carolus Linnaeus, 1707–1778）鉅著《系統》（拉丁文Systema Naturae）其一生中改編過12次（1735年第一版）。
此書中，自然界被劃分為三個界：礦物、植物和動物。
林奈了四個分類級：綱、目、屬和種。
你叫上面那種蔬菜「胡蘿蔔」、「紅蘿蔔」、「紅菜頭」、「蘿蔔仔」還是「carrot」呢？生物有多種名稱，但每個生物只有一個學術上使用名稱。
讓我們一起來探索吧！改寫後內容:
這種蔬菜生物學中「Daucus carota subsp. sativus」名字稱呼，這是一個瑞典博物學家卡爾·林奈所制定命名系統「學名」。
學名兩個詞組成，是屬名和種小名，例如Homo sapiens（智人）。
豬學名使用拉丁文拼寫。
例如，豬屬名是Sus，它是拉丁文中詞彙。
有時候，其他語言會使用拉丁字母來表示豬學名，並且可能會詞彙拉丁化，例如菲律賓疣豬學名是Sus philippensis。
書寫學名時，我們會斜體字書寫，或者是其下加下劃線。
一、為何生物要命名及分類
紀念達爾文誕辰兩百週年(Charles Darwin 200)，全球各地2009年舉辦各種演化論研討會。
相比之下，2007年是一个纪念年份，因为我们庆祝了分类学父、瑞典植物学家林奈（Carolus Linnaeus, 1707~1778）诞辰300周年。
這反映了當今生物學界演化和分類看法。
分類視為一門傳統學科，只需要少數學者博物館內進行研究。
而演化視為尖端創新和生命科學領域。
殊不知生命科學研究起源於分類工作
(binomial system)，各種生物統一命名，即以拉丁文給予一個屬名加上種小名學名；並建立一個界、門、綱、目、科、屬、種有階層、有系統分類架構。
否則地球上同種生物可能還是各命其名，各行其是。
分類目的及其重要性，即於地球上每一個物種一個統一名稱（學名）。
爾後，人人彼此之間才可以溝通，科學家彼此間會知道研究材料是否屬於同一個物種，研究結果是否應存入同一個檔案夾內。
否則，錯誤歸因可能導致後果。
然而，無法證實這符合自然界並且是唯一親緣關係分類系統。
或者，如果我們錯誤地注射了毒蛇血清，可能會我們生命造成威脅。
因此，我們應該對待這些情況。
林奈《植物哲學》一書中，他提到了一個觀點：“如果你知道他們名字，你會失去他們知識。
”這句話提醒我們要對待事物標記和歸類。
如果我們停留事物名字上，而深入瞭解它們本質和特徵，那麼我們知識可能變得和。
因此，我們應該通過深入研究和觀察，來獲取層次知識和理解。
林奈另一个贡献是形态和习性相似物种中，建立了一个分层分类系统。
這個系統不僅能夠將物種進行系統化分類，檢索、存檔、組織和檢索物種信息，還能預測生物特徵相似度，從而推斷它們行為模式相似。
分類結果可以讓我們欣賞地球上生物多樣性美，同時生態保育和資源管理工作起到幫助。
分類系統架構本身，例如檢索表，可以地反映物種之間演化和親緣關係。
（圖二）這樣分類系統雖然早期神創論時代並提及，但它於達爾文一百年後提出演化論有著啟示作用。
三、無止境爭議
早期分類於交通、通訊以及研究方法落後，所以同一物種會檢視標本數及文獻資訊交換，而複命名，產生「同物」問題，或是生物類羣生物被用了同一個拉丁字來命名，產生「異物同名」問題。
這些問題可命名規約來處理及解決。
譬如條紋蓋刺魚(Pomacanthus imperator) 成魚，因其幼魚體色截然不同，而命名為完全屬種名－夏刺蝶魚(Holacanthus bishopi)，直到後來經潛水實地研究，及水族缸飼育，觀察到轉變中間型體色，這發現到牠們原來是種。
Pomacanthus imperator因為優先命名權而成為名稱，而Holacanthus bishopi成為同種（圖三）。
異物同名是指生物類群具有名稱。
1878年时候，南中國一群魚分學者发现了一种爬鰍類，他们这种鱼起了个名字叫做纓口鰍屬Crossostoma。
但，早在1851年，这个名字一类蝸牛身上了。
所以，避免，他们纓口鰍屬改名纓口台鰍屬Formosania。
有些屬名使用，譬如Anthias之字串查詢資料庫，會發現植物中用過9次，動物中命過4次。
至於同一種標本中，後來發現存在有別種例子多，這些應不算是規約中異物同名，如剌尻魚(Centropyge flavissima) 中發現有另一種海爾剌尻魚(C. heradi)(圖四)。
改寫後內容如下：
Sillago sihma中，鰾末端分叉表示另一種鰾，名S. asciatica。
**注意：請提供參考來源。
**最近分類學者利用DNA或生命條碼(DNA barcoding)工具發現了許多形態相近，但是種隱藏種(cryptic species)或相似種(sibling species)例子。
如台灣帶魚，其實共有三種，包括確定是否為南海帶魚一個確定種。
反之有原本認為是三個科深海魚，是同一科魚類幼魚、雄魚及雌魚生活史時期（圖五）。
早期分類於交通、通訊以及研究方法落後，因此同一物種會檢視標本數及文獻資訊交換，進而複命名，導致「同物」問題產生，或者生物類羣生物使用拉丁字來命名，產生「異物同名」問題。
這些問題可命名規約來處理及解決。
改寫後內容：
夏刺蝶魚（Holacanthus bishopi）是一種成魚擁有條紋魚類。
這種魚幼魚身上顏色成魚完全，因此被誤認為是一個物種，並命名夏刺蝶魚。
然而，通過深入潛水研究和水族缸飼養觀察，我們發現它們是一種轉變中物種。
這一發現改變了我們夏刺蝶魚認識。
延伸閱讀…
Pomacanthus imperator因為命名優先權而成為名，Holacanthus bishopi變成了（圖三）。
而是指物種給予名字。
1878年，南中國的一羣爬鰍類學者建立了一個名Crossostoma纓口鰍屬。
這個名字1851年於一種蝸牛身上。
因此，Crossostoma重新命名纓口台鰍屬Formosania。
有些屬名使用，譬如Anthias之字串查詢資料庫，會發現植物中用過9次，動物中命過4次。
至於同一種標本中，後來發現存在有別種例子多，這些應不算是規約中異物同名，如剌尻魚(Centropyge flavissima) 中發現有另一種海爾剌尻魚(C. heradi)(圖四)。
或Sillago sihma中，鰾末端分叉否命了另種S. asciatica。
最近，科學家們利用DNA或DNA條碼技術，發現了許多外觀相似但屬於物種例子。
這些物種可能是隱藏種或者是相似親物種。
他們通過分析物種基因組成，揭示了這些物種之間差異和相似之處。
這項研究於我們地理解生物多樣性和物種演化有著意義。
如台灣帶魚，其實共有三種，包括確定是否為南海帶魚一個確定種。
反之有原本認為是三個科深海魚，是同一科魚類幼魚、雄魚及雌魚生活史時期（圖五）。
分類問題之一，分類學者種定義及種界定各持己見，無法協，命名規約管不到。
這分類學界所謂細分學者(splitter)及粗分學者(lumper)兩派，分類理念有所不同。
前者認為只要找到一些形態上顯著差異，命名新種；但後者認為這些差異應視為種以下地理區或族羣間變異。
於此一問題普遍存在於各種生物類羣，統計各類羣物種數時，地提供一個確切數目，而多半只能粗估約略種數。
縱使利用DNA之序列來作及鑑種，會個體、族羣、亞種或種間遺傳距離要於多少，才可以判定屬或種，而有所爭議。
至於「屬」以上階分類系統架構變動頻，學派各有其擁護者，提出這些分類系統學者，各有其資料及佐證來支持他們各自論點。
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如果您需要進一步幫助，請提供原文，我提供指導和建議。
謝謝！問題於這些特徵或形質組，演化過程中可能會走上路徑，並且同一個形質組中特徵之間可能會發生改變，這樣會產生平行演化、趨同演化和逆轉異源同形問題。
使得分類系統只能在假設演化走是短路徑情況下，選擇樹。
這種方法稱為進化儉約説。
然而，無法證實這符合自然界並且是唯一親緣關係分類系統。
延伸閱讀…
縱使TOL資料庫建成，只是我們達成了一個共識妥協結果。
進行推估親緣樹採樣過程中，我們需要注意取樣偏差、測量誤差、編碼、轉碼以及建構親緣樹所使用方法。
這些因素可能親緣樹結果產生影響。
因此，選擇使用方法時，我們需要考慮。
即使我們完全解碼了所有生物DNA，透過生物資訊學各種分析建構出親緣樹，我們無法完全解決同塑問題。
所謂分子親緣樹只是一個無法證實理論而已。
除非有一天，人類能夠發明時光隧道機器，讓我們目睹地球上生命起源，以及它是如何演化成我們現在所見多樣化生物世界。
這樣，我們才能建立一個分類系統架構，並重新命名所有高級生物群體，從而平息一切分類學上爭議。
改寫後內容：
Randall Kosak説：「分類學是一種科學，於物種進行分類和命名」。
分類學通過將物種歸入屬和以上分類單位，使用單名法來表示。
種用兩個字表示，即雙名法，物種名稱屬名和種名（有人稱種加名）構成。
亞種三個字表示，即三名法，直接種名後加上亞種名。
學名後面要有命名人和命名時間，命名人和命名時間之間加上逗號“,”
有時候屬名後可以加上用括號括起亞屬名，而使用時不用寫這些。
如果命名有修正，命名人加上括號。
屬名和命名人第一個字母要寫，種名和亞種名用寫，屬名、種名和亞種用斜體字，其它名稱字。
如果前面提到，後面屬名和種名可以縮寫，縮寫後面要加點“.”。
名稱一行寫不下時，應該音節進行分行，不可音節拆開，同時要使用“-”連接。
例：
Felidae Gray, 1821 貓科
Panthera Oken, 1816 豹屬
Panthera tigris (Linnaeus, 1758) 虎（種） (可以寫成Panthera (tigris) tigris (Linnaeus, 1758))
Panthera tigris altaica (Termminck, 1845) 東北虎（亞種） (如果前面提到過華南虎，東北虎名字可簡寫P. t. altaica)林耐Linnaeus最初虎命名時歸入是貓屬，虎原名Felis tigris Linaeus, 1758
東北虎原名Felis tigris altaica Termminck, 1845。
現在虎歸入豹屬，所以命名人加上了括號。
生物命名一個基本原則——優先律，即一個生物分類單位名稱，應以正式刊出名稱準。
如果發現同物或者異物同名情況，應保留名稱，廢除晚命名。
屬動物不能有屬名，屬植物不能有屬名，一個屬中不能有兩個種有種名。
但是動物和植物可以有屬名，屬中可以有種名，但是親緣關係切屬中應避免種名，以免分類調整歸為一屬時候發生。
學名中可以看到一些縮寫和符號，如：aff. 是affinis縮寫，寫種名前，意為，翻譯親種，古生物常用，如原始鼻犬親近種 Simocyon aff. primigenius Roth et Wanger, 1855原始鼻犬Simocyon primigenius Roth et Wanger, 1855有親緣關係。
cf. 是conformis縮寫，於種名之前，意為相似。
翻譯相似種，表示親種關係密切。
古生物學中使用，例如史前似北豺Coun cf. alpinus（Pallas, 1811），這種現生北豺（即豺狗）Coun alpinus（Pallas, 1811）特徵上相似，但無法確定是否屬於同一種。
var. 是varietas縮寫，代表變種。
它植物或動物種名後，變種名之前使用。
主要於表示地理上變種，可以於其他類型變種。
例如，我們國家鵝學名是Anser cypnoides var. domestica，表示家鵝馴化變種。
mut. 是mutatio縮寫，意為變種，表示時間意義上變種，但時間意義上變種常用var.而不用mut.，mut.很少使用。
indet. 是指indeterminata縮寫，表示確定屬或種。
emend. 是指emendatio縮寫，表示修改或訂正，於屬、科以上分類單位。
當在屬名前使用?時，表示於該屬或種有疑問或確定。
當在屬名後使用?時，表示該屬名無法確定。
當在命名人後使用?時，表示該種名無法確定。
以下是改寫後內容：
et 是和意思，例如兩個人聯合命名二人間加上et，例如泥河灣巨劍齒虎Megantereon nihowanensis，如果命名認為三人以上，一個人後面加上et al.，例如南雄階齒獸Bemalambda nanhsiungensis。
gen. 是屬genus縮寫，sp.和spp.是種species縮寫，sp.是種單數，spp.是種的複數，sp.寫屬名後，表示不能確定種名種。
nov. 是nova縮寫gen. nov.表示屬，sp. nov.表示新種，gen. et. sp. nov.表示第一次發表新種、屬。
nom. nud. 是nomen nudum縮寫，意為“赤裸名稱”。
該詞是於表示一個得像學名，或是本來打算其用作學名但沒有使用名稱。
因為該名稱充分描述一起發表，所以既是一個“裸體”名稱。
其正式場合是不能接受。
動物分類學中，一個動物物種可以往下細分，應用三名法來命名一個亞種 （有時稱種族race），例如新西蘭普通鸕鷀 Phalacrocorax carbo 其它地方有所不同， 所以歸入一個亞種 Phalacrocorax carbo novaehollandiae。
動物學使用一個層級分類系統，以便將物種分類。
因此，亞種名之前，需要插入一個層級指示符，以便人們可以明確辨認亞種名稱。